کاربرد نقشه های خودسازمان ده در آنالیز و طبقه بندی داده های میکروآرایه سرطان سینه
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر
- نویسنده رقیه ابوالقاسمی
- استاد راهنما بهرام صادقی بی غم مهدی وثیقی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1393
چکیده
تجزیه، تحلیل و طبقه بندی داده های میکروآرایه یکی از موضوعات چالش برانگیز در حیطه بیوانفورماتیک است. از مهم ترین ویژگی های داده های میکروآرایه، ابعاد بسیار بالا (تعداد ژن های زیاد) در برابر تعداد کم نمونه ها می باشد. این عامل، باعث بروز مشکلات و چالش هایی در زمینه تحلیل این نوع داده ها شده است. بنابراین از روش های انتخاب ویژگی و کاهش ابعاد داده ها جهت حل این مشکلات و ارائه مدلی ساده تر و دقیق تر استفاده می شود. در این پژوهش، روشی برای یافتن ژن های حاوی اطلاعات و همچنین طبقه بندی داده های میکروآرایه ارائه گردیده است. روش پیشنهادی از سه بخش اصلی تشکیل شده است. در بخش اول، ابعاد داده ها با استفاده از شبکه عصبی som غیر نظارتی کاهش یافته و به فضایی شامل نورون ها نگاشت می شود. در بخش دوم، به وسیله الگوریتم ژنتیک، زیرمجموعه های بهینه حاوی نورون ها استخراج شده و نورون ها رتبه بندی می گردند. در آخرین بخش، ژن های حاوی اطلاعات با ارزش انتخاب می گردند. در این روش به علت استفاده از شبکه عصبی som ، ژن های خلاصه سازی شده برای انتخاب ویژگی استفاده می شوند که همین امر باعث کاهش زمان محاسباتی انتخاب ویژگی نسبت به روش هایی است که خلاصه سازی در آن ها صورت نمی گیرد. همچنین به علت عدم استفاده از روش های آماری (آزمون (t جهت رتبه بندی مجزای ویژگی ها، تمامی ژن ها یا نمایندگان آن ها در مراحل انتخاب ویژگی و ساخت مدل شرکت دارند. روش پیشنهادی بر روی یکی از مجموعه داده های پرچالش که مربوط به میکروآرایه سرطان سینه است، جهت طبقه بندی نمونه ها و انتخاب ویژگی (ژن ها) بر اساس دو نوع تومور لومینال و غیرلومینال به کار گرفته شد و توانست میانگین صحت طبقه بندی مدل ها را در اعتبارسنجی متقاطع ?? تایی، نسبت به روش های پیشنهادی قبلی بر روی همین داده ها از ?? درصد به ?? درصد برساند. علاوه بر این، ژ ن های انتخاب شده به عنوان ژن های حاوی اطلاعات با ارزش، از لحاظ عملکردهای زیستی، از عوامل موثر در تمایز دو نوع سرطان لومینال و غیرلومینال می باشند که همین امر، قدرت روش پیشنهادی را در بهبود مدل های طبقه بندی و انتخاب ویژگی های موثر هرچه بیشتر بیان می نماید.
منابع مشابه
استخراج اتوماتیک تپه های بزرگ ماسه ای ریگ ییلان، شرق کویر لوت با استفاده از نقشه های خودسازمان ده
اشکال متفاوت از تپه‌های ماسه‌ای حدود 20 درصد از سطح بیابانهای جهان را پوشانده، که زمین ریخت‌شناسی آنها همواره از دیدگاههای مختلف مورد توجه بوده است. روشهای سنتی نقشهبرداری زمین ریخت‌شناسیک کیفی و یا بر پایهی عملیاتهای میدانی، به دلیل شرایط خاص و دشوار حاکم بر بیابانها بسیار زمانبر و پرهزینه است. به ویژه زمانی که منطقه‌ای منحصر به فرد نظیر دشت لوت شامل تپه‌های بزرگ ماسه‌ای در مقیاسی بزر...
متن کاملطبقه بندی راه های شهری مبتنی بر ادغام در سطح تصمیمات داده های نوری و راداری
در این مقاله قابلیت تصاویر اسپات و سار به منظور تشخیص عارضه راه در مناطق شهری مورد بررسی قرار گرفته است. شباهت طیفی عارضه راه با سقف آسفالت ساختمان ها در مناطق شهری موجب بروز مشکلاتی در تشخیص راه مبتنی بر داده های اپتیک از جمله اسپات می گردد. از سوی دیگر، تصاویر سار با اینکه قابلیت خوبی در تشخیص راههای فرعی و باریک دارند، اما در تشخیص راه از پوشش گیاهی دچار مشکلاتی می شود. بنابراین، نتایج حاصل ...
متن کاملبررسی تأثیر باند حرارتی و الگوریتم های طبقه بندی نظارت شده داده های ماهواره ای در تهیه نقشه های کاربری اراضی (مطالعه موردی: کاشان)
امروزه دادههای سنجش از دور قادر به ارائه جدیدترین اطلاعات برای مطالعه پوشش زمین و کاربریهای اراضی میباشند. این تصاویر بدلیل ارائه اطلاعات به هنگام، تنوع اشکال، رقومی بودن و امکان پردازش در تهیه نقشههای کاربری از اهمیت بالایی برخودارند. مشخص کردن موقعیت هر کاربری و پوشش اراضی در کنار یکدیگر کمک شایانی به مدیران مناطق جهت تصمیمگیری میکند. همچنین با استفاده از نقشههای کاربری اراضی در سطوح مخ...
متن کاملکاربرد خوشه¬بندی در تهیه نقشه¬های شبه¬ زمین¬شناسی با استفاده از داده¬های ژئوفیزیک هوابردی
از جمله کاربردهای دادههای ژئوفیزیک هوابرد، تهیه نقشه شبه زمین‌شناسی است. در این نوع نقشه‌ها، محدوده هر واحد زمین‌شناسی و عوارض ساختاری چون خطواره‌ها را از روی تغییرات جانبی و تلفیق انواع دادههای ژئوفیزیکی مشخص می‌کنند، اما جنس واحدهای زمین‌شناسی نا‌مشخص خواهد بود. البته در ادامه امکان تطابق‌دهی بین این نقشه و عوارض زمینی و مارک‌دار کردن نقشه مربوطه وجود خواهد داشت. در این مقاله، با استفاده از...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023